לקוח שמעוניין לפרוע את הלוואת המשכנתא לפני סיום המשכנתא בכדי לבצע פעולות שונות כמו מחזור המשכנתא, עשוי הלקוח להיות מחויב בעמלת פרעון מוקדם ע״י הבנק.
לפני פרעון מוקדם של הלוואת המשכנתא יש לברר באמצעות מוקד הבנק או הבנקאים השונים על כמה כנס הפרעון המוקדם עומד. הבדיקה תתבסס על השאלה האם יגרם לבנק הפסד מפרעון מוקדם של הלוואת המשכנתא או לא, וזאת באמצעות חישובי ריביות שנגבו מהלקוח בתחילת המשכנתא ביחס לריביות הקיימות בשוק ביום פרעון המשכנתא.
תשלומי משכנתא רוב נוטלי המשכנתא מופתעים לגלות שלאחר כמחצית מתקופת המשכנתא, נותרת יתרת חוב שדומה לקרן ההלוואה אותה לקחו בתחילה, כאילו לא החזירו את חובותיהם במשך כל התקופה.
רבים גם בטוחים כי ישנה בעיה באופן חישוב הנעשה ע״י הבנק. הסיבה לכך שרוב נוטלי המשכנתא משלמים בתקופה הראשונה (בעיקר) את ריבית ההלוואה אותה הן נטלו, בעקבות שיטת חישוב המשכנתאות בישראל. אומנם ניתן למצוא טעויות בחישוב פה ושם אך כאשר תנאי הלוואת המשכנתא הוזנו למערכת, והתשלום החל, לא אמורים להיות טעויות חישוב שנעשות ע״י תוכנת הבנק.
לקוחות ותיקים לקוחות הבנק חושבים שאם הם לקוחות הנמצאים באותו הבנק תקופה ארוכה(לקוחות ותיקים ומוערכים), והבנק הבטיח לתת את התנאים הטובים ביותר בבנק - אזי הם באמת יקבלו תנאים מועדפים. בעקבות כך, לקוחות אלו אינם בודקים הצעות בבנקים נוספים ויכולים להנזק בעשרות ואף מאות אלפי שקלים משום שלקוחות אלו יקבלו תעריפים גבוהים מהנהוג בבנק. מומלץ לברר מהם התנאים שניתן לקבל בפועל ואף לדרוש מסמך המעיד על ריכוז התנאים אותם הבנק מציע לכם. בשלב השני לברר מהם התנאים המתאים להם ביותר. מומלץ שכל דבר יהיה בכתב אחרת בהמשך יהיה קשה להוכיח שהם קיבלו את התנאים המסוימים מאותו הבנק.